Структура доходов федерального бюджета определяется не только на стадии его формирования, также она зависит от фактического поступления доходов, прежде всего - налогов.

Различают три основных вида доходов:

1. Налоговые поступления (налог на прибыль; НДС; акцизы; лицензионный сбор на право производства, разлива и хранения алкогольной продукции; платежи за пользования природными ресурсами; ввозные таможенные пошлины; налог на доход физических лиц; специальный налог с предприятий, учреждений, организаций, другие налоги, сборы и пошлины).
2. Неналоговые доходы (доходы от имущества, находящегося в федеральной собственности; доходы, поступающие от внешнеэкономической деятельности; другие неналоговые доходы).
3. Доходы целевых бюджетных фондов (Федерального дорожного фонда Российской Федерации, фонда развития таможенной системы Российской Федерации, Межведомственного фонда развития системы и налоговой службы Российской Федерации, Государственного фонда борьбы с преступностью, Федерального экологического фонда Российской Федерации).